Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNCBQ16143 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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