Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZIC1Q15915 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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