Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SYCP1Q15431 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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