Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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