Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms