Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF2H2Q13888 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms