Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA7Q13683 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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