Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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CUL1Q13616 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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