Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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