Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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TOP3AQ13472 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TOP3AQ13472 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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TOP3AQ13472 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TOP3AQ13472 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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