Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPA4Q13156 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPA4Q13156 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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