Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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