Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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