Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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NFIAQ12857 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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NFIAQ12857 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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NFIAQ12857 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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NFIAQ12857 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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