Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXO1Q12778 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXO1Q12778 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXO1Q12778 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXO1Q12778 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXO1Q12778 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXO1Q12778 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
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FOXO1Q12778 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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FOXO1Q12778 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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FOXO1Q12778 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXO1Q12778 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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