Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPFP49454 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPFP49454 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPFP49454 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPFP49454 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CENPFP49454 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CENPFP49454 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CENPFP49454 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPFP49454 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPFP49454 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPFP49454 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CENPFP49454 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms