Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPREP23469 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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