Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTIFO43310 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTIFO43310 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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