Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CRXO43186 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CRXO43186 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms