Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms