Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK4Q9UBT3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms