Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDAP2Q9NXN4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms