Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms