Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms