Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRIP1Q9BX63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRIP1Q9BX63 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms