Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms