Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR2Q969E8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms