Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPGRQ92834 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms