Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms