Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms