Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF4Q8WXU2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms