Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf3Q8BYK6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf3Q8BYK6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms