Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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