Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHBQ15464 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHBQ15464 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHBQ15464 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms