Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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