Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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