Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAP1Q01518 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAP1Q01518 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms