Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFDNP55196 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms