Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms