Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB2P26583 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms