Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNB1P20700 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNB1P20700 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms