Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms