Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254aP0DN89 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms