Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms