Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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