Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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