Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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