Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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