Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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TNXAQ16473 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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