Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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